軍機(jī)處的設(shè)立，最初只是作為內(nèi)閣的一個分支機(jī)構(gòu)存在，且由朝臣輪流兼任，并無定員，雖然其繞過內(nèi)閣，直接由皇帝決議軍國大事，引起了朝臣的警惕，但初時只涉及民變及邊關(guān)兵事，且確實(shí)提高了效率，故沒有引起朝臣們的足夠重視。
    但隨著崇禎三年皇太極寇關(guān)之戰(zhàn)結(jié)束后，朝臣們這才發(fā)現(xiàn)，皇帝已將錦衣衛(wèi)并入軍機(jī)處，作為軍機(jī)處情報機(jī)構(gòu)，使得軍機(jī)處職權(quán)大增，不知不覺完成了君權(quán)的加強(qiáng)，內(nèi)閣的作用，已被無限削弱。
    得益于這兩年孫承宗穩(wěn)扎穩(wěn)打，構(gòu)建寧錦防線，再加上何邪的先知先覺和火器的大量推廣，崇禎三年這場戰(zhàn)斗，并沒有被皇太極避開寧遠(yuǎn)、錦州突入關(guān)內(nèi)，遼東諸將拒敵于關(guān)外，一場持續(xù)三個月的大戰(zhàn)，使得野豬皮傷亡慘重，最終一無所獲，退回沈陽。
    皇太極深以為恥，誓報此仇。
    而明軍軍紀(jì)渙散，戰(zhàn)斗力差已是積重難返之事，這一戰(zhàn)，明軍同樣損失慘重，傷亡人數(shù)甚至和野豬皮不相上下。
    但這一戰(zhàn)最終還是大明取得了勝利，且獲得的好處，是顯而易見的。
    首先，陜西彈壓民變正如火如荼，連年饑荒，朝廷缺銀缺糧，即使皇帝一再免除陜西、山東等災(zāi)區(qū)的賦稅，并撥糧賑災(zāi)，且甘薯也解決了一小部分燃眉之急，但天災(zāi)人禍，依然無法避免。
    在這樣雙線作戰(zhàn)的情況下，遼東之戰(zhàn)能取得這樣的成果，已是殊為不易，極為難得了。
    其次，經(jīng)此一戰(zhàn)，野豬皮實(shí)力大損，短期內(nèi)是無力再次發(fā)動戰(zhàn)爭了，孫承宗可以繼續(xù)推動他的戰(zhàn)略，穩(wěn)扎穩(wěn)打練兵修路，開辟京東屯田。
    而值此全球性的小冰河災(zāi)變時期，野豬皮想要生存下去，唯一的路就是往朝鮮打，往蒙古打，去獲取生存物資。
    大明朝沒時間修生養(yǎng)息，也沒那個條件，但趁著這段寶貴的和平時期，可以平定內(nèi)亂，徹底穩(wěn)定國內(nèi)局勢。
    最后，經(jīng)此一戰(zhàn)，軍機(jī)處的地位徹底被凸現(xiàn)出來，君權(quán)得到了進(jìn)一步的加強(qiáng)和集中，錦衣衛(wèi)在此一戰(zhàn)表現(xiàn)活躍，把情報網(wǎng)絡(luò)鋪到了關(guān)外。而且皇帝趁此戰(zhàn)提拔了一些人才，進(jìn)入了軍機(jī)處，如史可法、劉肇基等人。
    崇禎三年一月，帝冊封皇子朱慈恒為太子，以戒嚴(yán)免升殿，百官聽宣敕于午門，行十二拜禮。
    四月，帝不滿陜西焦灼戰(zhàn)局，增兵陜西，于陜北將賊眾合圍，一戰(zhàn)而徹底平定陜西，張獻(xiàn)忠兵敗被殺，李自成不知所蹤。
    陜西平定后，皇帝修建水運(yùn)，調(diào)南方錢糧，定北方天災(zāi)。
    自此后五年，大明進(jìn)入漫長的“崇禎新政”改革時期。
    帝改革稅收制度，重啟商稅，改東廠為大明稅務(wù)局，魏忠賢為首任稅務(wù)總督。
    這一舉措效果很明顯，東廠番子、錦衣衛(wèi)和地方官員，形成了一個相互監(jiān)督、相互制約的局面，雖然東廠動則抄家的狠辣手段遭到百官如潮彈劾，但僅僅崇禎四年一年的稅收，就足足頂?shù)纳线^去三年的總和。
    于是，無論是內(nèi)閣還是六部官員都閉嘴了。
    改革的過程自不是一帆風(fēng)順的，這期間，皇帝也失敗過，例如開海禁一事，由于沿海富商和官員的阻撓，不得不被迫放棄；又如東廠收稅期間欺壓百姓，魚肉鄉(xiāng)里，激起民變，一度使得稅收工作停滯，甚至皇帝不得不暫時罷黜魏忠賢，于次年才復(fù)啟。
    好消息是，大明有錢了，商稅征收已成定局，且甘陜山東一帶的饑荒由于甘薯的大量普及，得到了有效緩解。
    另，皇帝練新軍五萬，以史可法為帥，以徐光啟為新軍教官，駐守京師。
    大明朝就這樣磕磕絆絆走過了五年，這五年，各地災(zāi)禍依然頻發(fā)，時不時有饑民暴動，但相比起原歷史，已經(jīng)好了太多太多。
    崇禎六年，帝納周氏姐妹為妃，同年，丁皇后誕下公主，賜號長平。次年，周氏姐妹誕下一子一女。
    崇禎九年，魏忠賢病逝，皇帝追封其為忠國公，謚號“忠義”。王崇恩繼任大明稅務(wù)總督職位。
    同年，裴綸升任錦衣衛(wèi)指揮使，南鎮(zhèn)撫司改組監(jiān)察院，監(jiān)察廠衛(wèi)法紀(jì)，沈煉為第一人檢察院都指揮史。
    十月，毛文龍率部下耿忠明叛明降清，帝大怒，召滿朝文武廷議攻打金人事宜，百官紛紛反對，帝無奈作罷。
    十一月，叛將毛文龍自朝鮮海路攻入關(guān)內(nèi)，以尚可喜為內(nèi)應(yīng)，攻陷登州，虎視萊州；而皇太極又親自統(tǒng)領(lǐng)八旗軍十萬，避開寧遠(yuǎn)、錦州，分兵三路從龍井關(guān)、洪山口、大安口突入關(guān)內(nèi)，攻占遵化，京師告急，大明烽煙再起！
    帝震怒，下決心要把皇太極留在關(guān)內(nèi)。
    帝以京城為餌，豎壁清野，誘敵深入，令遼東、宣府、及冀州三處呈合圍之勢，斷八旗軍后路，又以新軍統(tǒng)領(lǐng)京城防護(hù)。
    萊登方面，帝命孫傳庭入山東，又派韓曠、盧劍星前往朝鮮行合縱之事，令盧象升出陜?nèi)媵?，和孫傳庭兵合一處。
    這是崇禎朝最大的一場戰(zhàn)役，這場戰(zhàn)役，一戰(zhàn)奠定了大明中興的基礎(chǔ)，也奠定了崇禎大帝的不朽之名！
    皇太極在京城下遭遇了火炮、炸藥等新軍火器殘酷摧殘，丟下三萬尸體，倉皇而逃，孫承宗、史可法等將領(lǐng)得皇帝吩咐，穩(wěn)扎穩(wěn)打，步步合圍，將皇太極困于空城遵化，圍而不打。
    崇禎十年三月，皇太極被饑?yán)Ы^望的蒙古兵所殺，金人開城投降，帝不允，四萬之眾，皆坑之。
    滿朝歡騰！
    與此同時，毛文龍敗退朝鮮，敗朝鮮官兵，割城而據(jù)。
    崇禎皇帝的威望，到達(dá)了前所未有的巔峰！
    三月二十七，皇太極之子毫格繼位，多爾袞攝政，統(tǒng)領(lǐng)金人兵馬大權(quán)。
    四月初一，帝以孫承宗為帥，以史可法為副將，出山海關(guān)，反攻金人。五月十三，史可法以炸藥、火炮克遼陽，金人死傷無算！
    五月二十，分兵撫順，以蒙古各部為內(nèi)應(yīng)，攻克撫順，袁崇煥屠城三日，被御史彈劾，帝命其戴罪立功。
    五月二十七，大明合圍沈陽。
    絕望的金人，爆發(fā)了驚人戰(zhàn)力！
    這一戰(zhàn)，盡管大明有火器之利，但仍死傷兩萬有余，金人五萬人馬全軍覆沒，多爾袞與皇宮中殺后宮嬪妃及皇子公主，舉火自焚而死，皇子毫格不知所蹤。
    金朝自此正式滅亡！
    割據(jù)朝鮮的毛文龍很快向皇帝求罪乞降，帝命盧象升、孫傳庭格殺勿論。遂此二部和李氏朝鮮軍合圍，徹底殲滅毛文龍所部，毛文龍、耿忠明被部下所擒，尚可喜戰(zhàn)死軍中。
    崇禎十年六月十六，毛文龍、范文程等明奸被押赴京城，于菜市口凌遲處死，數(shù)萬百姓觀刑，無不爭啖其肉，爭飲其血。
    崇禎十一年，大明開海事局，分別以史可法、鄭芝龍、李定國為將，分三個艦隊，遠(yuǎn)征海路。
    崇禎十四年，鄭芝龍于葡國海戰(zhàn)中戰(zhàn)死，帝賜其子鄭森爵位，追封鄭芝龍為忠勇伯。同年，史可法、李定國滿載而歸。
    大明真的發(fā)達(dá)了，海路貿(mào)易的繁榮，徹底夯實(shí)了大明中興的基礎(chǔ)，源源不絕的財富自海上而來，使得國內(nèi)災(zāi)禍帶來的損失得到極大程度的彌補(bǔ)和緩解。
    崇禎十七年，帝遷都南京，同年，萬邦來朝！
    崇禎大帝在位三十二年后，大明已徹底變成了一個資本主義開始蓬勃發(fā)展的帝國，自崇禎十七年始，皇太子朱慈恒便開始游歷大明各地，甚至曾出海而行，這位年輕的太子對于新事物接受很快，同時，也由于韓曠等老臣教導(dǎo)，并不失沉穩(wěn)。
    崇禎三十三年，天子改革吏治，在國子監(jiān)外令設(shè)軍校、工校，農(nóng)校。
    但改革實(shí)施了一半，丁皇后病重，旬月后撒手人寰，與世長辭。
    帝悲慟不已，連續(xù)三月無心朝政。
    崇禎三十三年七月二十七，崇禎帝退位，太子朱慈恒繼位，年號乾亨，崇禎被尊為太上皇。
    太子延續(xù)了父親的執(zhí)政思路，仍大刀闊斧改革，而經(jīng)過崇禎一朝的努力，大明人才輩出，這些人才的出現(xiàn)，使得大明盛世再現(xiàn)，已成定局。
    隨著兩位周貴妃相繼過世，太上皇常獨(dú)守空宮，怔怔發(fā)呆。
    崇禎三十四年八月，太上皇召太子密談達(dá)旦，次日于皇極殿中設(shè)宴，酒罷，太上皇舉杯笑言：“吾欲歸天命，眾愛卿，寡人去也。”
    遂當(dāng)場消失不見，群臣嘩然！天下嘩然！
    崇禎死后，乾亨帝及群臣追謚其廟號為恒宗。
    崇禎、乾亨二朝，被后世稱為崇乾盛世，也被認(rèn)為是華夏由封建王朝轉(zhuǎn)化為資本主義帝制的開端。
    崇禎皇帝歸天命，飛升天界之事，也成為后世永遠(yuǎn)解不開的謎團(tuán)。